Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CITO14578 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CITO14578 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CITO14578 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CITO14578 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CITO14578 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CITO14578 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CITO14578 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITO14578 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITO14578 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITO14578 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITO14578 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CITO14578 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms