Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRTO14522 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRTO14522 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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