Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA3O00505 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA3O00505 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms