Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPIPA5E9PKD4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms