Protein–RNA interactions for Protein: C9JCJ5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JCJ5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9JCJ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9JCJ5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9JCJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9JCJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms