Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVV-2B6SEH9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVV-2B6SEH9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms