Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYSRT1A8MQ03 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms