Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KNCNA6PVL3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms