Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LIPT2A6NK58 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIPT2A6NK58 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms