Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC69A6NI79 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC69A6NI79 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms