Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCP1A6NGW2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRCP1A6NGW2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms