Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC160A6NGH7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms