Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VPS37CA5D8V6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS37CA5D8V6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms