Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV10-3A0A0K0K1G6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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