Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U3KQE9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQE9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQE9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQE9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms