Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R4GMQ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
R4GMQ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
R4GMQ9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
R4GMQ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R4GMQ9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R4GMQ9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R4GMQ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
R4GMQ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
R4GMQ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms