Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms