Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX10Q9Y5X0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms