Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms