Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PHLDA3Q9Y5J5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHLDA3Q9Y5J5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms