Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FARP1Q9Y4F1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FARP1Q9Y4F1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms