Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KIF3AQ9Y496 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms