Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KNSTRNQ9Y448 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KNSTRNQ9Y448 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms