Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF13BQ9Y275 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFSF13BQ9Y275 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF13BQ9Y275 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms