Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMC3Q9UQE7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMC3Q9UQE7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms