Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SETD1BQ9UPS6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms