Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALKQ9UM73 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALKQ9UM73 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms