Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PADI3Q9ULW8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI3Q9ULW8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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