Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
DENND2AQ9ULE3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENND2AQ9ULE3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms