Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PADI1Q9ULC6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PADI1Q9ULC6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms