Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MBD1Q9UIS9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MBD1Q9UIS9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MBD1Q9UIS9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms