Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPA4Q9UI42 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPA4Q9UI42 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPA4Q9UI42 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms