Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms