Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COPS7AQ9UBW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COPS7AQ9UBW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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