Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RRBP1Q9P2E9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms