Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CABP1Q9NZU7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CABP1Q9NZU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CABP1Q9NZU7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms