Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NOP53Q9NZM5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NOP53Q9NZM5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms