Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms