Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP4R2Q9NY27 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP4R2Q9NY27 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms