Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GDAP2Q9NXN4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDAP2Q9NXN4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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