Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TOR4AQ9NXH8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms