Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM28Q9NW13 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBM28Q9NW13 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM28Q9NW13 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM28Q9NW13 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBM28Q9NW13 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBM28Q9NW13 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms