Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMILIN3Q9NT22 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMILIN3Q9NT22 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMILIN3Q9NT22 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms