Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CENPMQ9NSP4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms