Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCC13Q9NSE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCC13Q9NSE7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms