Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SALL1Q9NSC2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SALL1Q9NSC2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms