Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELLSQ9NRZ9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms