Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SERINC1Q9NRX5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms