Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD163L1Q9NR16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD163L1Q9NR16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms