Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CNGB3Q9NQW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CNGB3Q9NQW8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB3Q9NQW8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB3Q9NQW8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CNGB3Q9NQW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNGB3Q9NQW8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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